בבית ספר "יצחק שמיר" מתקיים פרוייקט חונכות של תלמידי כיתות ה' החונכים את תלמידי כיתות א'. פרוייקט החונכות מאפשר לתלמידי כיתות א' לחזק את תחושת הביטחון והשייכות לבית הספר החדש, בעוד שעבור תלמידי כיתות ה', מהווה הפרוייקט קרקע לגילוי אחריות, בגרות ומחויבות. החונכים תורמים מזמנם כדי לבלות עם הילדים הקטנים, החניכים. יחד הם משוחחים, משחקים בהפסקות ונפגשים במפגשים משותפים וקבועים יחד עם מחנכות הכיתות. במהלך המפגשים משתתפים התלמידים בפעילויות שונות ומגוונות, מכירים זה את זה, מפתחים ומחזקים קשרים בינאישיים ותורמים לאקלים החיובי בבית הספר.